当公司收到税务部门开具的罚单时，应当遵循以下步骤进行处理：

一、了解罚款原因

首先，需要详细了解被罚款的具体原因。税务罚款通常是因为违反了税收法律法规，如未按时申报、未足额缴纳税款、偷税漏税等行为。了解原因后，可以针对性地采取措施，避免再次违规。

二、确认罚款金额和期限

在了解罚款原因后，应仔细查看罚单上的罚款金额和缴纳期限。税务机关会出具相关的罚款通知，其中会明确罚款金额和缴纳期限。务必在规定的期限内缴纳罚款，以免产生滞纳金等额外费用。

三、整改违规行为

缴纳罚款的同时，应针对被罚款的违规行为进行整改。例如，如果是因为未按时申报或未足额缴纳税款被罚款，那么应尽快完成申报并补缴税款。整改完成后，可以向税务机关提交相关证明材料，以便税务机关核实。

四、申请行政复议或提起行政诉讼

如果对税务机关的罚款决定有异议，可以在规定的期限内申请行政复议或提起行政诉讼。在申请行政复议或提起行政诉讼前，建议先咨询专业律师的意见，了解相关的法律程序和注意事项。同时，应注意保留相关证据，如财务资料、沟通记录等，以便在必要时为法律纠纷提供证据支持。

五、加强税务合规管理

为了避免再次被罚款，公司应加强税务合规管理。具体包括：建立健全的内部控制制度，确保财务和税务工作的规范性和准确性；定期对员工进行税务法规和财务知识的培训，提高全员的税务合规意识；定期自查税务工作，及时发现并纠正存在的问题。

综上所述，当公司收到税务部门开具的罚单时，应保持冷静、理性应对。通过了解罚款原因、确认罚款金额和期限、缴纳罚款、整改违规行为、申请行政复议或提起行政诉讼以及加强税务合规管理等措施，公司可以更好地维护自身的合法权益。

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